Палестинська академія науки і техніки була заснована в 1994 році Організацією визволення Палестини на прохання ЮНЕСКО. Вона була офіційно створена Указом Президента № 114 у 1997 році, яким визнавався її статус автономної, неурядової та некомерційної організації. Цей указ уповноважив Академію служити основним органом з питань науки і техніки в країні, доручаючи їй консультувати з питань розробки політики, програм і проектів для підтримки національного розвитку, а також координувати відповідну науково-технічну (НТ) діяльність. Як наслідок, Академія стала центральним центром і головною організацією з питань науки і техніки в Палестині.
Доктор Фатхі Арафат був призначений її першим президентом, а Його Високоповажність Ясір Арафат, президент Палестинської національної адміністрації, обіймав посаду почесного президента.
У 1998 році першим Генеральним секретарем Академії було призначено доктора Рафіка Аль-Хусейні. У 2000 році його змінив на посаді виконуючого обов'язки Генерального секретаря доктор Мохамед Зіара, а на початку 2001 року – доктор Імад Аль-Хатіб, який спочатку виконував обов'язки Генерального секретаря, а потім був призначений Генеральним секретарем пізніше того ж року. Віце-президентом Академії було призначено доктора Хікмата Аджурі.
Статус Академії було підтверджено Указ Президента № 13 від 2004 року (В Англійська) , що сприяло подальшому утвердженню її як національної, незалежної, самоврядної установи. Палестинська академія науки і технологій відіграє вирішальну роль у розвитку науки, технологій та інновацій у Палестині та їх використанні як рушійних сил економічного, соціального та людського розвитку. Для досягнення цієї мети Академія тісно співпрацює з партнерами з академічних кіл, уряду та промисловості, як на місцевому, так і на міжнародному рівні. Координація та оптимізація національних зусиль є особливо важливою, враховуючи обмежені ресурси та значні виклики, з якими вона стикається. Штаб-квартира Академії знаходиться в Єрусалимі, а додаткові офіси – в Рамаллі та Газі.