IFSM є членом з 1976 року.
Міжнародна федерація товариств мікроскопії була створена ICSU у 1951 році як Об’єднана комісія з електронної мікроскопії. У 1955 році вона стала незалежною федерацією з метою розвитку міжнародної співпраці між мікроскопістами. Федерація має три регіональні комітети, 38 національних товариств-членів і 6 національних товариств-членів.
