Чеська академія наук є членом з 1922 року.
Академія наук Чеської Республіки є однією з організацій-наступниць Чехословацької академії наук, яка представляла Чехословаччину в ISC з 1952 року. До цього Чехословаччину представляла Чехословацька національна дослідницька рада. Академія наук функціонує як об'єднання 54 науково-дослідних інститутів у галузі природничих і технічних наук, соціальних і гуманітарних наук. Він відповідає за функціонування 36 національних комітетів і представляє Чеську Республіку в ISC, його комітетах і наукових спілках. Національні комітети складаються з представників університетів та науково-дослідних установ Чеської Республіки. У січні 2015 року вона змінила назву на Чеську академію наук.